《X档案 第一季》围绕着联邦调查局探员福克斯·穆德和达娜·斯嘉丽展开。穆德因妹妹在童年时离奇失踪，坚信有超自然现象存在，执着于调查各类神秘案件，被安排到专门处理超自然事件的“X档案”部门。斯嘉丽则是医学博士，受上级指派监视穆德，以科学理性的视角看待案件。 在第一季中，他们遭遇诸多离奇事件。比如在《冰》一集中，他们前往阿拉斯加调查一种外星寄生虫，这种寄生虫能控制人类意识，导致一系列恐怖事件发生。还有《幽灵公路》里，神秘的幽灵卡车不断制造死亡事故。穆德和斯嘉丽在调查过程中，观点时常碰撞，却也在合作中逐渐建立起信任。每一集都充满悬疑、惊悚元素，展现出一个神秘莫测的超自然世界。