《魔法少女伊莉雅：魔法少女in温泉旅行》中，主角伊莉雅和好友们开启了一场欢乐的温泉旅行。在旅途中，她们遇到了各种各样有趣的事情。美游对温泉旅馆的豪华设施惊叹不已，而远坂凛则对温泉的水质和周边环境评头论足。然而，平静的旅行被突然出现的神秘魔法阵打破，一群奇怪的魔法生物从阵中涌出，开始在温泉旅馆捣乱。伊莉雅等人立刻变身为魔法少女，与这些魔法生物展开战斗。战斗过程中状况百出，有的魔法少女不小心滑倒，有的魔法攻击还误伤到了同伴。但她们凭借着团队的默契和各自的魔法能力，最终成功击退了魔法生物，让温泉旅行重新恢复了欢乐的氛围。