《神样DOLLS》的故事围绕着少年来栖晓展开。来栖晓原本过着平凡的生活，然而在父母离奇死亡后，他被祖父接到了一个神秘的地方。在这里，他结识了拥有强大力量的人偶——神样DOLLS。晓被卷入了人偶之间的战斗，这些人偶拥有各自独特的能力和性格。其中，晓与名为夜刀的人偶建立了紧密的联系，夜刀性格傲娇但实力强劲。他们一同面对各种敌人，在战斗中不断成长。随着故事推进，晓逐渐揭开了父母死亡以及人偶背后的惊天秘密，也明白了自己肩负的使命。在一次次的战斗和冒险中，晓和夜刀等人的羁绊不断加深，共同为了守护重要的东西而努力拼搏。