《雷加利亚三圣星》的故事围绕着三位少女展开。在雷加利亚这个世界中，魔法与科技并存。少女们分别是拥有强大魔法天赋的艾莉丝、擅长机械发明的露娜以及精通剑术的蕾欧娜。她们因不同的缘由相聚在一起，共同为守护雷加利亚而战。 艾莉丝原本生活在宁静的魔法村落，却因黑暗势力的侵袭失去了家园，从此踏上寻找真相与复仇之路。露娜则是机械都市的天才少女，为了改进城市的防御系统而不断努力。蕾欧娜出身于剑术世家，肩负着守护圣地的使命。 三人相遇后，组成了“三圣星”。她们在一次次与邪恶势力的战斗中，逐渐成长，彼此间的羁绊也愈发深厚。面对强大的敌人，她们发挥各自的特长，一次次化险为夷。她们的冒险不仅关乎个人的命运，更决定着雷加利亚世界的存亡。