《魔装学园H×H》故事围绕着转校生赤龙帝·朱利安展开。他转入了只有女生的私立天雾学园，这所学园是培养能够操纵被称为“武装”的魔力装具的魔术师的学校。赤龙帝在学园里遭遇了各种状况，他被学园里的学生们视为异端。尤其是与学园里的剑巫少女天雾绫斗，两人最初冲突不断。 随着剧情发展，赤龙帝展现出了自己特殊的能力，他的“绝对双刃”能力让他在战斗中有着独特的表现。学园中不断有敌人出现，他们为了各种目的袭击学园，赤龙帝与天雾绫斗等人逐渐放下成见，携手应对危机。在一次次战斗中，他们的关系变得更加紧密，同时也揭开了学园背后隐藏的秘密，一场关乎学园命运和世界平衡的大战逐渐拉开帷幕。