《小小克星！Refrain》承接前作剧情，围绕着直枝理树等人展开。理树在学园生活中继续成长，结识了更多伙伴。在学园里，他们经历着各种日常琐事，有欢笑也有泪水。而在这看似平凡的生活背后，却隐藏着不为人知的秘密。 随着故事推进，理树等人发现了学园中神秘的存在和特殊的现象。他们开始探寻真相，在这个过程中，友情得到了进一步的考验和升华。同时，理树与女主角们之间的感情也逐渐加深，每个人都有着自己的故事和内心的伤痛。 在 Refrain 篇章中，剧情走向高潮。他们面临着重大的抉择和挑战，要克服重重困难，解开谜团。故事不仅展现了青春的美好与纯真，更探讨了生命、亲情、友情和爱情的深刻意义，以细腻的情感和精彩的剧情打动人心。